Formados en 1973, originalmente por Juan Carlos Fontana, Lito Epumer y Rubén Alcaraz (que a los pocos meses dejaría su lugar a Pedro Aznar), este trío realiza pocas presentaciones en vivo, pero que alcanzan para dejar claro la gran dúctilbilidad de estos instrumentistas.

Hacia 1975 Epumer es reemplazado por Enrique Sinesi y la banda entra en un prolongado paréntesis que se transforma en definitivo cuando Epumer y Fontana pasan a formar parte de Spinetta Jade en 1980.

En 1985 el grupo vuelve a tomar forma incorporando a Jota Morelli en batería y Cesar Franov en bajo (al poco tiempo es reemplazado por Guillermo Vadala) con esta formación realizan varias presentaciones en vivo y graban el único disco de la banda que se edita a fines de 1986.

La nueva formación de Madre Atómica muestra un sonido enriquecido con respecto a la primera formación de la banda e incorpora elementos del Jazz Fusión.

Los cambios continuaron en el grupo y luego de la salida del disco, Pomo ingresa en lugar de Jota Morelli.

La banda deja de presentarse y se disuelve nuevamente en 1987.

Durante el 1993, 94 y 95 el grupo realiza tres breves retornos, siempre de la mano de Lito Epumer, pero no dejan registros grabados.